南部、北部およびウェスタンブロッティングの違い|サザンブロットとノーザンブロットとウェスタンブロッティングとの比較

Anonim

主要な相違 - 北部対南部およびウェスタンブロッティング

DNA、RNAおよびタンパク質の特定の配列の検出は、分子生物学における研究の種類。ゲル電気泳動は、DNA、RNAおよびタンパク質をそのサイズに応じて分離する技術である。ゲルプロファイルから、特定のDNA配列、RNA配列、またはタンパク質は、標識されたプローブによるブロッティングおよびハイブリダイゼーションと呼ばれる特別な技術によって検出される。ブロッティング法には、南、北、西の3種類があります。北部の南部と西部のブロッティングの主な違いは、サンプルから検出する分子の種類にあります。サザンブロット法は、DNA試料から特定のDNA配列を検出する方法である。ノーザンブロッティングは、RNAサンプルから特定のRNA配列を検出する技術である。ウエスタンブロッティングは、タンパク質サンプルから特異的なタンパク質を検出する方法です。

目次

1。概要と主な相違点

2。サザンブロッティングとは

3。ノーザンブロッティングとは

4。ウエスタンブロッティングとは

5。サイドバイサイド比較 - ノーザンvsサザンvsウェスタンブロッティング

6。要約

サザンブロッティングとは?サザンブロッティング技術は、DNAサンプルから特定のDNA配列を同定するために、1975年にE.M。サザンによって開発された。これは、分子生物学において導入された最初のブロッティング技術である。それは、DNAからの特定の遺伝子、DNAからの特異的フラグメントなどの検出を可能にした。サザンブロッティング技術に関連するいくつかのステップがある。彼らは以下の通りです。

<! DNAを試料から単離し、制限エンドヌクレアーゼで消化する。消化した試料をアガロースゲル電気泳動で分離する。ゲル中のDNA断片は、アルカリ溶液を用いて一本鎖に変性される。一本鎖DNAを毛細管転写によりニトロセルロースフィルター膜に転写する。移されたDNAは膜上に永久的に固定される。

メンブレン上の固定DNAを標識プローブとハイブリダイズさせる。結合していないDNAを洗浄により膜から洗い流す。 X線フィルムを膜に曝し、オートラジオグラフを作成する。

  1. サザンブロッティングは、分子生物学のさまざまな側面に適用されます。RFLPマッピング、法医学的研究、遺伝子発現におけるDNAメチル化、遺伝子障害における突然変異遺伝子の検出、DNAフィンガープリンティングなどに有用です。図9:サザンブロット法
  2. ノーザンブロッティングとは?ノーザンブロッティングは、サンプルから特定のRNA配列またはmRNA配列を検出して遺伝子発現を研究するために設計された方法である。この技術は、1979年にAlwine、Kemp、Starkによって開発されました。これは、いくつかのステップのために南部および西部のブロッティング技術とは異なります。しかしながら、この技術は、ゲル電気泳動、ブロッティング、特異的標識プローブおよび検出とのハイブリダイゼーションによっても行われる。ノーザンブロッティング技術は以下のようにして実施される。試料からRNAを抽出し、ゲル電気泳動により分離する。 RNAをゲルからブロッティング膜上に移して固定する。膜は、cDNAまたはRNAから調製された標識されたプローブで処理される(プローブは、サンプル中の特定の配列に相補的である)。プローブは、膜とインキュベートされて、特定の配列と結合する。
  3. 結合していないプローブが洗い流される。ハイブリダイズされた断片は、オートラジオグラフによって検出される。ノーザンブロッティングは、ハイブリダイズしたmRNAの検出および定量、RNA分解の研究、RNA半減期の評価、RNAスプライシングの検出、遺伝子発現の研究​​などにおいて重要なツールである。図9:ノーザンブロット法
  4. ウェスタンブロッティングとは何ですか?ウエスタンブロッティングは、標識された抗体を用いてタンパク質混合物から特定のタンパク質を検出する方法である。したがって、ウエスタンブロットはイムノブロット
  5. とも呼ばれます。この技術は、1979年にTowbin
  6. et al
  7. によって導入され、タンパク質分析のためにラボで日常的に実施されています。手順は次のとおりです。タンパク質をサンプルから抽出する。ポリアクリルアミドゲル電気泳動を使用して、タンパク質をそのサイズにより分離する。分離した分子を、エレクトロポレーションによりPVDF膜またはニトロセルロース膜に移す。999。膜を非特異的結合についてブロックする。トランスファーされたタンパク質は、一次抗体(酵素で標識された抗体)と結合する。非特異的に結合した一次抗体を除去するために膜を洗浄する。結合した抗体を、基質を添加し、形成された着色沈殿物を検出することによって検出する.999ウェスタンブロッティングは、ヒト血清サンプル中の抗HIV抗体の検出に有用である。ウエスタンブロットはまた、B型肝炎感染の確証検査および狂牛病の確定検査として使用することもできる。
  8. 図03:ウェスタンブロッティング
Northern SouthernとWestern Blottingの違いは何ですか?

<! - ノーザンブロット法は、RNAサンプルから特定のRNA配列を検出する。ノーザンブロッティングは、RNAサンプルから特定のRNA配列を検出する。サザンブロッティング(Southern blotting)サザンブロッティングは、DNA試料から特定のDNA配列を検出する。

ウェスタンブロッティング

ウェスタンブロッティングは、タンパク質サンプルから特定のタンパク質を検出する。

ゲルの種類

  1. ノーザンブロッティング
  2. アガロース/ホルムアルデヒドゲルを使用します。
  3. サザンブロッティング
  4. アガロースゲルを使用します。
  5. ウェスタンブロッティング
  6. ポリアクリルアミドゲルを使用します。

ブロッティング法

ノーザンブロッティング

これは毛細管移動である。

サザンブロッティング これは毛細管移動である。 ウエスタンブロッティング これは電気転写です。 使用されたプローブ

  1. ノザンブロット法
  2. cDNAまたはRNAプローブが放射性または非放射性に標識されている。サザンブロッティングDNAプローブは、放射性または非放射性に標識される。
  3. ウエスタンブロッティング

    一次抗体がプローブとして使用される。

  4. 検出システム
  5. ノーザンブロッティング
  6. これは、オートラジオグラフまたは光または色の変化の検出を用いて行われる。
  7. サザンブロッティング

これは、オートラジオグラフ、光の検出または色の変化を用いて行われる。

ウエスタンブロッティング

これは、光または色の変化の検出を用いて行われる。要約 - ノーザンvsサザンブロットおよびウェスタンブロッティング

ブロッティングは、サンプルから特定のDNA、RNAまたはタンパク質を同定するために開発された特殊技術である。特定の種類の分子を検出するために、北、南および西の3つの別々のブロッティング手順がある。ノーザンブロッティング技術は、RNAの混合物から特定のRNA配列を検出するように設計されている。サザンブロッティング技術は、DNA試料からの特定のDNA配列の検出を可能にし、タンパク質混合物から特定のタンパク質を同定するためのウェスタンブロッティング技術が開発される。

参考文献1。ギボンズ、ヤナイ。ウエスタンブロット:タンパク質転写の概要。 "北アメリカ医学雑誌。 Medknow Publications&Media Pvt Ltd、2014年3月。ウェブ。 2017年3月27日

2。 Brown、T. "サザンブロッティング。 "免疫学の現在のプロトコル。米国国立医学図書館、2001年5月。ウェブ。 2017年3月27日
3。彼、Shan L. "ノーザンブロット。 "酵素学の方法。米国国立医学図書館、2013年。ウェブ。 2017年3月27日 画像提供:
1。 RNA405による "ノーザンブロットスキーム" - コモンズウィキメディアによる自己の仕事(パブリックドメイン) 2。 "Western blot 114A" Amanthabagdonによる - Commons Wikimedia経由での自分の作品(パブリックドメイン)