ExomeとTranscriptomeの違い| ExomeとTranscriptomeの比較
主要な相違点 - Exome vs Transcriptome
遺伝子にはコード領域と非コード領域が含まれています。コード配列はエキソンとして知られており、非コード配列はイントロンとして知られている。遺伝子のエクソンのヌクレオチド配列は、特定のタンパク質を合成する遺伝子の遺伝子コードを表す。したがって、エキソンはmRNA分子に残っている。ゲノムの総エクソン領域はエキソームとして知られており、ゲノムの重要な部分である。遺伝子の遺伝子コードは、タンパク質の産生に必要なmRNA分子の遺伝コードに変換される。一度に細胞または細胞集団で転写される全mRNA分子は、トランスクリプトームとして知られている。エクソームとトランスクリプトームとの間の重要な相違点は、
エクソンがゲノムのエキソン領域の配列 を表し、 トランスクリプトームが所与の時間における細胞または組織の全mRNAを表すことである。
目次1。概要と主な相違点
2。 Exomeとは何か？
3。トランスクリプトームとは
4。並行比較 - ExomeとTranscriptomeの比較
5。要約
Exomeとは何ですか？遺伝子は、エキソン、イントロンおよび調節配列からなる。エキソンは、転写中にmRNA配列に転写される遺伝子領域である。イントロンおよび他の非コード領域は、転写中に除去される。エクソンのヌクレオチド配列は、それがコードする特定のタンパク質を合成する遺伝子の遺伝コードを決定する。タンパク質のmRNA内にはエクソンのみが残る。ゲノム中のエクソンの集合は、生物のエキソムとして知られている。それは遺伝子中で発現されるゲノムの一部を表す。ヒトでは、exomeはゲノムから1％を占めています。これは、ヒトゲノムのタンパク質コード部分である。
図01：Exome
トランスクリプトームとは何ですか？トランスクリプトームは、所与の組織におけるすべてのタンパク質コード化および非コード化転写物（RNA）の集合である。トランスクリプトームは、細胞または組織中の遺伝子によって発現される全mRNA分子の集合を表す。細胞のトランスクリプトームは、別の細胞型のトランスクリプトームで変化させることができる。トランスクリプトームは動的でもあり、内部刺激と外部刺激の両方に応答して時間とともに変化します。同じ組織内または同じ細胞型内であっても、トランスクリプトームは数分後に変化する可能性があります。
<！トランスクリプトームは、生物のエキソームとは異なる。トランスクリプトームは、発現されたエクソン配列のみを含む。細胞のエクソームは同じままであるが、トランスクリプトームは、遺伝子発現がすべての細胞または組織について同じではないため、細胞によって異なる。必須の遺伝子のみが異なる細胞および組織で発現される。遺伝子発現は、組織または細胞型特異的プロセスである。それは環境要因を含む様々な要因によって規制されている。したがって、トランスクリプトームは、外部環境条件によって変化し得る。トランスクリプトームは、プロテオミクス研究のための前駆体として使用される。全てのタンパク質はmRNA配列に由来する。翻訳の修飾は、タンパク質の変化をもたらし得る。しかしながら、トランスクリプトームは、プロテオーム研究のための重要な基礎情報を提供する。
図02：胚性幹細胞のトランスクリプトーム
ExomeとTranscriptomeの違いは何ですか？
<！ - Except vs TranscriptomeExomeは、遺伝子のタンパク質コード領域のコレクションです。トランスクリプトームは、mRNAを含む全転写RNAの集合体である。サンプル999 ExomeをDNAサンプルを用いて研究する。トランスクリプトームは、RNAサンプルを用いて研究される。
研究方法
全exome sequencingはexomeを研究する方法です。
